El territorio de L´Alfàs se caracteriza, desde el punto de vista medioambiental, por poseer una valiosa riqueza biológica, fruto de la diversidad de ecosistemas que ofrece al coexistir, en un mismo territorio, una zona litoral acantilada, una zona montañosa, como lo es Serra Gelada, y usos agrarios tradicionales caracterizados por cultivos de cítricos y nísperos mayoritariamente; todos ellos con la presencia casi constante del pino, símbolo del municipio y que se manifiesta en la mayoría de las zonas del territorio, tanto urbanas, semiurbanas y naturales, con especies como el pino carrasco (Pinus halepensis) y el piñonero (Pinus Pinnea).

En estas tierras se conservan aún ejemplares arbóreos valiosos de especies agrícolas típicamente mediterráneas, que cobraron importancia en la economía rural de épocas pasadas, como el olivo (Olea europaea) y el algarrobo (Ceratonia siliqua).

En el aspecto faunístico es de destacar la riqueza ornitológica del término municipal, con especies comunes, en cualquier zona del municipio, como las currucas, mirlos, petirrojos, carboneros, aviones, mitos, etc., así como una variada avifauna marina que domina la zona acantilada de Serra Gelada y donde las colonias de gaviota patiamarilla comparte el espacio marino con especie como el cormorán moñudo, la gaviota reidora, la gaviota de audouin, el halcón peregrino, etc.